martes, 10 de abril de 2012

iTunes U puede vincular la Informática biomédica, el estudio de las ciencias biomédicas básicas y bioquímica

La nueva aplicación de Apple permitirá al usuario acceder a cursos de las más universidades prestigiosas en el mundo en cualquier lugar, en cualquier momento a través de dispositivos electrónicos como la Mac o desde el iPhone, iPod o iPad. Ya sea en forma de podcast o conferencias en línea. Además de que sirve como una herramienta para las mismas universidades para poder brindar contenidos a los estudiantes.
Por ejemplo, uno puede tomar el curso de Biochemistry 501 por la Univerdidad de Wisconsin, a través de clases y conferencias transmitidas a manera de podcast. 
También se puede acceder al curso del profesor Ben MacFarland  de la Universidad de Seattle, que se titula como Bioquímica (BIO/ CHM 4362)-2012

Descripción
Invierno de 2012. El segundo trimestre de la serie de Bioquímica de tres cuartos, la introducción de la integración de los conocimientos químicos adquiridos sobre los sistemas biológicos de la bioquímica caída trimestre. El tema principal, el metabolismo, se discutirá a partir de biosignaling y continuando hasta el catabolismo, anabolismo, y la regulación de las vías bioquímicas

Ahora ya no hay excusa para poder aprender Bioquímica o expandir tus conocimientos acerca de temas como biología molecular y metabolismo, de los profesores y científicos más experimentados.


lunes, 9 de abril de 2012

Bioinformática

Un artículo interesante que reflexiona en la bioinformática, una aliada cerca de la Bioquímica y la Biología Molecular. Espero lo disfruten!

http://www.aragues.com/blog/bioinformatica.pdf

Separando Fragmentos de DNA por electroforesis de Gel

Uno de los temas más complejos de éste bloque de Bioquímica y Biología molecular corresponde a la tecnología de DNA Recombinante. Una de las técnicas más utilizadas para éste fin, es la separación de fragmentos de DNA mediante electroforesis por gel. Un proceso aparentemente simple de entender, pero que tiene implicaciones científicas y de investigación que van más allá de lo aparente. Como parte de la colección "An evolutionary framework in Cell Biology" El presente tutorial hace éste procedimiento accesible y fácil, como apoyo para los contenidos que se revisan en éste bloque.

VISITA LA PÁGINA: http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/R/RecombinantPlasmid.gif

domingo, 1 de abril de 2012

Operón de Lactosa en E. Coli

Un vídeo que apoya el aprendizaje de la parte de regulación génica correspondiente al cuarto Bloque "Biología Molecular" del programa de Bioquímica y Biología Molecular para la Facultad de Medicina, UNAM. Ojalá les sirva :D

Teoría de Orbitales Moleculares

Un paréntesis en la bioquímica para abordar un concepto de Informática Biomédica esencial.
Orbital molecular para el Metano

Un concepto de química que ayuda a entender la estructura de todos los materiales químicos que existen en el universo es la teoría de Orbitales Moleculares, que explica la forma en la que se comportan los electrones dentro de una molécula y cómo ésta le confiere la mayoría de las propiedades intrínsecas que son particulares para diversos compuestos. Ésta entrada, si bien no necesariamente relacionada con el curso de bioquímica que ofrece la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México, demuestra la forma en que las universidades compilan información complementaria a los cursos que imparten, ya que éste pequeño curso de Teoría de OM es complemantaria al curso de Reacciones Orgánicas Pericíclicas ofrecida por el departamento de química en la Universidad Imperial de Londres. Es una lectura interesante pero, repito, no es estrictamente curricular.


Vsisiten el sitio: http://www.ch.ic.ac.uk/vchemlib/course/mo_theory/

¿Qué es un plásmido?

(Fuente: http://laguna.fmedic.unam.mx/~evazquez/0403/plasmidos.html)


Los plásmidos son moléculas circulares de ADN que se replican de manera independiente al cromosoma de la célula hospedera. De manera natural se encuentran en las bacterias en tamaños que van desde 5,000 hasta 400,000 pb.


Pueden ser introducidos en las células bacterianas por un proceso denominado transformación. Las células y el plasmido se incubas juntos a 0°C en soluciones de cloruro de calcio, posteriormente se da un incremento de temperatura al medio de entre 37 y 43 °C, alternativamente se puede utilizar un choque de corriente eléctrica en una técnica denominada electroporación.
El fenómeno que permite que las células incorporen a los plásmidos por estos métodos, no es claro.
A la fecha se han obtenido muchos plásmidos a partir de los que ocurren de manera natural. Todos los vectores de clonación deben al menos contener:


1.- Un origen de replicación para poder tener más de una copia del mismo en la célula infectada.
2.- Dos genes que confieran resistencia a diferentes antibióticos, lo que permite la identificación de las células que portan a dicho vector.


Traducción de RNA: Una guía (Australiana) Interactiva

El proceso de traducción de proteínas a partir de una molecula de RNA mensajero y con la ayuda de tRNA, es el proceso más importante para el metabolismo de ácidos nucléicos y, por ende, uno si no el más importante mecanismo para nuestro organismo. Bioquímica y Biología Molecular del grupo 1105 les invita a revisar éste tutorial preparado por el Instituto de Tecnología y el gobierno de Australia que hace el complejo proceso de replicación algo inusualmente divertido y fácil. La variación con respecto a los diversos tutoriales que se pueden encontrar en línea es que éste requiere participación efectiva por parte del usuario y lo involucra para que el resultado de aprendizaje sea aún más enriquecedor. El uso de recursos electrónicos para el aprendizaje no trata de sustituir el papel del maestro, sino más bien atender a las necesidades de la generación de la información, donde éste tipo de recursos son vitales.

VISITA EL SITIO: http://www.biotechnologyonline.gov.au/popups/int_translation.html

Transcripción de DNA: Nivel Avanzado

Para complementar el vídeo sobre transcripción publicado anteriormente, ésta versión más avanzada, más técnica pero con el mismo contenido visual que hizo de la primera toda una delicia audiovisual, llega ésta segunda parte que complementa con información más detallada el complejo proceso de transcripción de DNA. ¡Disfrútenlo!

Tutorial de Rutas Metabólicas

Uno de los mayores retos para el estudiante de primer año de la carrera de Médico Cirujano es ajustarse a una versión de la química con la que jamás se había enfrentado: La bioquímica. El Metabolismo, siendo la piedra angular del estudio del cuerpo humnao a nivel bioquímico, resulta un dolor de cabeza por sus numerosos pasos, reacciones y gastos energéticos involucrados. Para esto, la Universidad Estatal de Ohio, a través de The College of Education and Human Ecology y el Departamente de Nutrición humana han preparado un tutorial de rutas metabólicas que explican a detalle y usando imágenes simples y audio, los maravillosos mecanismos que hacen posible el funcionamiento bioquímico del universo. Denle un vistazo, vale la pena.



Proceso de Transcipción: Nivel Básico

Siguiendo con los vídeos de poyo para el aprendizaje de Biología Molecular, DNA Learning Center preparó un vídeo con el uso de microscopia electrónica de barrido para entender la forma en que éste proceso se lleva a cabo. Éste vídeo es meramente introductorio, conlleva los niveles básicos de transcripción sin ahondar demasiado. Youtube sirve para más que diversión, ¿verdad?

Replicación de DNA

Como parte del programa de Bioquímica y Biología Molecula, se incluye el tema de Replicación de DNA. Éste vídeo, producido por Garland Science, es una buena introducción al tema. Disfrútenlo!

lunes, 19 de marzo de 2012

Bioquímica Interactiva




Ésta vez le toca el turno a uno de los softwares educativos más sobresalientes con los que nos hemos topado durante nuestra formación profesional: Bioquímica Interactiva, un proyecto desarrollado en Flash por parte del Departamento de Bioquímica como apoyo para la materia. El software es elegante, limpio y es de suma utilidad para las tres primeras unidades temáticas. El mejor tema que desarrolla éste tutorial interactivo es, sin duda, los temas estructurales de agua, carbohidratos, lípidos y aminoácidos, en los que se incluye material capaz incluso de sustituir el material impartido en los libros o en clase ya que resume, de manera muy didáctica, los contenidos de dichos temas y además incluye cuestionarios de autoevaluación al final de cada tema.
El capítulo de "Metabolismo" no tiene tal impacto, pero resulta igualmente útil como repaso sobre todo para las unidades temáticas 2 y 3. Desafortunadamente, los contenidos temáticos correspondientes al apartado programático de "Biología Molecular" no han sido actualizados y se mantienen "En construcción", lo que quizá haga éste material un poco obsoleto para los temas más complejos de la segunda mitad del tercer bloque en adelante. Sin embargo, los contenidos en los que sí se adentra éste software están bien revisados y son un apoyo fundamental e irrefutable para las clase de ésta maravillosa materia.

Un problema menos

Cuando se hace una tarea para la clase de bioquímica a computadora una de las cosas que más molestan es la obvia incapacidad para dibujar moléculas orgánicas con precisión y elegancia, cualidad que puede marcar la diferencia entre cualquier trabajo y un MUY buen trabajo. E-molecules es un programa en línea que te permite dibujar estructuras, descargarlas y hallar similitudes para verificar nomenclatura. La bioquímica se hace más entretenida -visualmente hablando- cuando se lidia con moléculas representadas gráficamente, E-molecules es un software entretenido, fácil de usar y elegante que te permite hacer todo eso. ¿Qué esperas para probarlo?

¡Visítala! http://www.e-molecules.com

martes, 6 de marzo de 2012

Una introduccion a la bioquímica

Un video en Alta Definición que tiene como intenció servir de introducción al mundo de la Bioquímica. ¡Espero lo disfruten y lo encuentren útil!


Tecnología e Informática en la Bioquímica


LA TECNOLOGÍA INFORMÁTICA CONTRIBUYE A
FACILITAR EL APRENDIZAJE DE BIOQUÍMICA

En la actualidad se busca hacer uso de las tecnologías de la información más avanzadas para que cualquier estudiante con sólo escribir un nombre en un buscador de la Internet pueda obtener mucha información relacionada con el tema de su búsqueda; a pesar de esto, para que un conocimiento sea útil debe de ser relacionado con los conocimientos previos y ejercitado por medio de la resolución de problemas relacionados con el tema en estudio, de manera que el estudiante establezca la relación causa-efecto o tal vez comprenda la razón de una serie de pasos a seguir para encontrar la solución de un problema dado.

En el caso de la enseñanza de la Medicina, los futuros médicos tienen acceso a variadas publicaciones en la Internet que pueden servirles para hacer más fácil el aprendizaje tanto de las ciencias básicas como de la clínica. Últimamente, en la Facultad de Medicina de la UNAM se ha iniciado la correlación básico - clínica para ayudar a los alumnos en el aprendizaje de los conceptos y conocimientos que forman parte del curriculum de la Carrera de Médico Cirujano.

En la carrera de Médico Cirujano el aprendizaje de las ciencias básicas representa mucha dificultad para los estudiantes y la bioquímica es especialmente difícil, debido a que los conceptos acerca de las moléculas, de las vías metabólicas y de las interacciones involucradas en la transmisión y expresión de la información genética tienen un componente abstracto muy importante.

El diseño de programas para la enseñanza de la bioquímica asistida por computadora y distribuidos por medio de la Internet, ha demostrado ser una herramienta eficaz para facilitar la enseñanza en el  Departamento de Bioquímica y de Biología Molecular de la Facultad de Medicina de la UNAM y  actualmente el portal "APRENDE BIOQUÍMICA" ofrece a los estudiantes y a los docentes una colección de programas diferentes.

El Laboratorio de Diseño y Evaluación de Programas para la Enseñanza de Bioquímica Asistida por  Computadora fue iniciado y dirigido por la M. en C. Leonor Fernández Rivera Río desde 1993; fue el  pionero en el diseño y la evaluación de programas para enseñanza de la bioquímica y desde entonces ha  desarrollado 23 programas diferentes para facilitar la comprensión de las propiedades y las características estructurales de los carbohidratos, los lípidos, los aminoácidos, los nucleótidos, las proteínas y los ácidos nucleicos, así como las vías metabólicas más importantes; también ha desarrollado tres prácticas de  laboratorio simuladas.

Otra aplicación de la tecnología informática es la realidad virtual. El laboratorio de Diseño y Evaluación de Programas para la Enseñanza de Bioquímica Asistida por Computadora en unión con el Observatorio de Visualización IXTLI inició el proyecto "Estructura de biomoléculas como una herramienta para favorecer el aprendizaje de la Bioquímica y de la Biología Molecular" en la que se diseñaron programas para la  observación de moléculas en tercera dimensión (realidad virtual) que se pueden usar para impartir clases a  los estudiantes; con esta tecnología se puede ver a las moléculas simples y complejas en tercera dimensión y en tiempo real.

La asociación de la bioquímica con la clínica es útil, ya que existen muchos aspectos bioquímicos que involucran a la etiología, a las pruebas y a los análisis que se usan para el diagnóstico de las enfermedades y a los tratamientos que se emplean para contender con éstas, es por esto que se inicia el proyecto de  Correlación Bioquímica - Clínica que pretende desarrollar programas de enseñanza asistida por  computadora que muestren las alteraciones bioquímicas que son la causa de numerosas enfermedades; con  esto se espera facilitar el aprendizaje y establecer un puente entre las ciencias básicas y las ciencias clínicas. El proyecto incluye a varios programas en los que se analizarán el síndrome de gota, la intolerancia a la lactosa, la galactosemia, la diabetes, las enfermedades por atesoramiento de glucógeno, la enfermedad pulmonar obstructiva crónica, la enfermedad de Alzheimer y la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob o de las vacas locas y otros padecimientos, además, se analizarán los principios bioquímicos para la determinación de la concentración de diferentes sustancias que se usan comúnmente para hacer diagnósticos en la clínica. 

Estos programas serán publicados en el sitio "Aprende Bioquímica" del Portal de Internet del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la Facultad de Medicina de la UNAM. El desarrollo de esta nueva tecnología para facilitar el aprendizaje, ha sido para la Facultad de Medicina de la UNAM, un adelanto muy importante que la sitúa entre las más avanzadas del mundo, ya que la incorporación de programas tutoriales, simulaciones de prácticas de laboratorio, animaciones representando a las reacciones enzimáticas y las modificaciones de las moléculas en el metabolismo celular, así como de modelos moleculares en tercera dimensión en la Internet o en los Observatorios para realidad virtual, facilita en forma significativa la comprensión de la estructura tridimensional de las moléculas simples y complejas, como son los aminoácidos, los carbohidratos, los lípidos, las proteínas y los ácidos nucleicos y las estructuras subcelulares como el núcleosoma, el replicosoma y otros. Se espera que con el desarrollo de estos programas se pueda contribuir a fomentar el interés de los alumnos por el estudio de las ciencias básicas y se favorezca el diseño de procedimientos para mejorar la salud de la población usando como herramienta el método científico.


Fuente: http://redalyc.uaemex.mx/redalyc/pdf/490/49011480001.pdf
Leonor Fernández Rivera Río y
Marco Antonio Juárez Oropeza
Departamento de Bioquímica
Facultad de Medicina, UNAM
 
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